โรคต่อมาที่พบเป็นมากบนหอมหัวใหญ่และหอมแดงคือ #โรคแอนแทรคโนส ที่เกิดจากราชื่อคอลีทอตทีกัม โกลอีโอสปอริรอยเดส อาการที่พบเริ่มแรกจะเห็นจุดฉ่ำน้ำสีเขียวหม่นบนใบ เมื่อแผลขยายตัวออก เนื้อเยื่อของใบจะยุบตัวลง แผลมีสีน้ำตาลอ่อน ขอบแผลสีน้ำตาลเข้ม ตรงกลางแผลจะมีจุดสีดำเล็กๆ เกิดกระจาย ถ้าอากาศชื้นจะมีเมือกเหลวสีส้มอมชมพูเยิ้มออกมาบนแผล ถ้าสภาพอากาศแห้งลง จุดสีดำจะแห้งและแข็ง ใบเน่า หักพับ ต้นหอมจะยืนต้นตายอย่างรวดเร็ว เมือกเหลวสีส้มคือสปอร์ของราที่จะระบาดในแปลงปลูกโดยน้ำฝน และติดไปกับเมล็ดพันธุ์ได้ หากซากพืชที่เป็นโรคตกค้างอยู่ในแปลงปลูก สปอร์ของราสาเหตุจะอาศัยอยู่ในดินได้นานและรอเข้าทำลายพืชในฤดูปลูกต่อไป

โรคที่พบมากบนกระเทียมและกุยช่ายคือ #โรคราสนิม ที่เกิดจากรา พักซิเนีย อัลลิไอ ซึ่งเป็นราชั้นสูงสร้างส่วนขยายพันธุ์ที่มีผนังหนา และฝังตัวอยู่ในเนื้อเยื่อพืช ดังนั้นการใช้สารป้องกันกำจัดจึงยากมากกว่ารากลุ่มที่สร้างส่วนขยายพันธุ์ที่ชูขึ้นพ้นผิวพืช

อาการที่พบเป็นแผลจุดสีซีด คล้ายขีดเล็กๆ บนใบ ตามความยาวของแผ่นใบ แผลนูนขึ้นจากผิวใบเล็กน้อยสีเหลืองอมส้ม หรือที่เรียกว่าสีสนิม อาการของโรค จะปรากฎบนใบล่างก่อนลามขึ้นใบบนๆ แผลบนใบจะปริแตกออกภายในมีขุยสีสนิมหลุดออกมา อาการพบได้ทั้งบนใบและก้านดอก สปอร์สีสนิมระบาดไปในอากาศทางลม และความชื้นสูง ช่วยให้การระบาดเกิดได้มากขึ้น

การป้องกันกำจัดโรคของพืชตระกูลหอมที่เกิดจากเชื้อรา

• การเตรียมแปลงปลูกให้มีการระบายน้ำดี เนื้อดินโปร่ง มีค่าความเป็นกรด ด่างประมาณ 6.5-7.0 ซึ่งสามารถใช้ปูนขาวปรับปรุงดินก่อนปลูก ควรมีการไถดินในแปลงกลับไปกลับมา และตากแดดสัก 3-4 แดด เพื่อให้ปริมาณของศัตรูพืชในดินลดลง
• ก่อนย้ายกล้าลงปลูก ควรแช่ต้นกล้าในสารป้องกันกำจัดโรคพืช เช่น โปรคลอราช
• การพ่นสารป้องกันกำจัดโรคต้นเน่า โรคใบจุดสีม่วง และโรคแอนแทรคโนส ด้วยสารเคมี เมตาแลกซิล ผสม คาร์เบนดาซิม และสารกลุ่มไทอะโซล หรือ โปรคลอราช หรือโพรไซมิโดน ชนิดใดชนิดหนึ่ง เมื่อเริ่มพบอาการจุดเล็กๆฉ่ำน้ำบนใบ และพ่นซ้ำทุก 5 วัน หากยังพบว่ามีอาการให้เห็นอยู่ โดยเฉพาะในช่วงที่สภาพอากาศชื้นและเย็น การพ่นสารป้องกันกำจัดโรคพืชอย่างต่อเนื่องควรมีการสลับสารเคมีกับสารกลุ่มสัมผัส เช่น แมนโคเซบ หรือโปรปิเนบ เพื่อลดการดื้อยาของเชื้อสาเหตุ
• ส่วนโรคราสนิมของกุยช่าย และกระเทียม สารป้องกันกำจัดโรคที่ดี ได้แก่ แมนโคเซบ โปรคลอราช สารกลุ่มไทอะโซล พ่นเมื่อพืชเริ่มมีใบ 4-5 ใบ และพ่นต่อเนื่องทุก 10-14 วัน